Diferencias de vigor en líneas casi isogénicas de melón

Es evidente la diferencia de vigor tras 33 días tras plantación entre estas cuatro líneas casi isogénicas de melón (las del centro son mucho más vigorosas). Las dos centrales tienen introgresión en diferente cromosoma, mientras que las de las esquinas tienen introgresión en el mismo cromosoma que la central izquierda. La edad de las semillas era similar. Es importante resaltar que es posible que la estructura de la semilla pueda estar condicionando la necesidad de pretratamientos y de un protocolo especializado de germinación. Agradecer para este tipo de estudios la colaboración de Toni Monforte y Jordi García Mas (IBMCP, IRTA-CRAG).

Semillero 2012

En un par de semanas las plantas que llevaban 33 días en semillero (ver fotografía) pasarán a ser transplantadas al campo en nuestra campaña 2012. Salvando un par de líneas con un porcentaje de germinación menor de lo esperado, tenemos suficientes plantas para transplantar. Sospechamos que aunque la calidad del material y la edad de la semilla es importante, como trabajamos con líneas no élite, sino líneas casi isogénicas, existe una cierta componente genética que disminuye el éxito de germinación en estas líneas. Lamentablemente no podemos dedicarnos a este tipo de estudios, aunque tenemos evidencias de germinación de varios años y de que el vigor de las líneas con introgresión de la entrada PI 161375 en general es menor que en el caso del parental "Piel de sapo" que utilizamos.

Perfiles de aromas volátiles en melón

Interior del cromatógrafo Agilent 7890. Horno y columna
cromatográfica capilar para análisis de etileno.

Seguimos en el duro trabajo de establecer los perfiles de aromas volátiles en melón mediante cromatografía de gases-masas previo análisis del espacio de cabeza en zumo o en fruto entero. El trabajo exige una gran concentración y dedicación en tiempo ya que los resultados entre muestras no siempre son lo homogéneos que uno desease. De hecho tanto por fallos antes o después del muestreo, en la preparación de la muestra, o en el análisis (columna desgastada por ejemplo), pueden darse resultados anómalos. Y  después de ello hay que tratar de dar unos resultados coherentes descartando aquellos cuyo espectro no coincida con la calidad debida con el espectro descrito en las librerías de espectros de compuestos puros al uso. Muchos autores ni siquiera estándando este dato en sus artículos, cuando no olvidan incluso el tipo de fibra SPME que están utilizando, el liner del equipo de cromatografía o las columnas o condiciones cromatográficas. Todo ello y muchas cosas más son detalles muy importantes para un buen análisis químico.
Posteriormente estamos teniendo dificultades con la reproducibilidad de algunos compuestos en las muestras (que exigen en algunos casos integración manual), coelución de compuestos (no es nada raro que el 2% de todos los que encontremos), compuestos procedentes de fibra o anormales para el melón (algunos autores describen hasta siloxanos como compuestos de melón cuando simplemente se deben a una reacción con el PDMS de la fibra), etc., etc. En esta investigación están trabajando Noelia dos Santos, Libia Acened Chaparro Torres, la técnico del SAIT-UPCT María José Roca y quien les escribe (Juan Pablo Fernández Trujillo) También nos ayuda contestando a nuestras dudas (y mucho) Pablo Castillo  de Proquimur (Grupo Biomaster).

En clase

En clase del Máster en Tecnologías Avanzadas en Investigación y Desarrollo Agrario y Alimentario que ahora gestiona la Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica (ETSIA) de la UPCT hemos estado viendo este blog como ejemplo de generación de información. Los alumnos han visto lo sencillo que es crearse un blog, seleccionar un tipo de plantilla, cambiar sus opciones para incluir texto o fotografías, títulos, etc. Esperamos que lo intenten por ellos mismos para divulgación de la postcosecha, el procesado mínimo y la refrigeración, calidad y seguridad de productos hortofrutícolas tanto a nivel de empresa como de I+D+i. Este es el primer año en que imparto este contenido dentro del Máster en la estrategia de que los alumnos sean capaces de generar (y publicar) su información.

Foto 1. Alumnos del Máster con los profesores JP Fernández-Trujillo y el profesor Jean Claude Pech, el 11 de Noviembre de 2011.

Research experiences



Foto. Manipulation of a flame
 ionization detector
to clean up the gas
chromatography for
ethylene measurements.





Looking for a brief research experience (<1 year) out of your country having the financial support to cover your expenses?

We offer some selected researchers and students the opportunity of having an experience using melon fruit samples as a model system.

The results can be used for preparing a master thesis, final project for engineers, or other simmilar purposes by signinig the corresponding confidential agreement.

Several students from UPCT and other universities were able to complete his degree with us and have a great experience in a Mediterranean city.




TOPICS

a) Melon aroma volatiles. Extraction, GC-MS analysis, training in integration and data analysis. 2011-2013.

b) Melon polyssacharide content ant flesh properties (January-April 2012).

c) Transcriptomic analysis. Quantitative PCR to validate microarray results. 2011-2012.

d) Multivariate statistics. 2011-2013.

e) Melon microorganisms. 2011-2012.

You can work with other students and researchers with contrasted experience. Contact juanp.fdez@upct.es

Note: Please if you are interested in using research as an excuse for othre purposes, just choose other offers.  Thank you for your interest.

Melones amarillos y verdes ecológicos de fuera de temporada

ISOECO es una iniciativa social de ecoempleo que está produciendo en Fuente Álamo además de otras hortalizas melón verde y amarillo. Para quien quiera solicitárselos este es su enlace en FACEBOOK.
Hoy anunciaban los primeros: 500 kg de melón verde y 100 kg de melón amarillo. Ecológicos, de semillas autóctonas no comerciales y comprometidos con el empleo y la sostenibilidad social y ambiental.
https://www.facebook.com/?q=#/pages/ISOECO/178386108903592
Dejando un mensaje en su facebook contactan contigo.

Trabajando con fines docentes con los microchip de ADN del melón

Horchatería Daniel (Alboraya, Valencia)

Durante unos días estamos trabajando con datos de microchip de ADN de melón obtenidos tras extraer el correspondiente ARN total de pulpa del fruto. Estamos colaborando con Ximo Cañizares profesor del departamento de Biotecnología de la Universidad Politécnica de Valencia e investigador en el COMAV, localizado en la Ciudad Politécnica de la Innovación (http://www.comav.upv.es/).  Y de paso,  como amantes del sabor y el buen gusto, saboreando y degustando la excelente horchata de Alboraya.


Ximo Cañizares haciendo un PCA (19 Septiembre 2011) en el COMAV (Valencia).



Estamos trabajando para preparar una práctica con datos ya normalizados previamente con el programa Multi Array Viewer, lo que sería mucho más fácil si las conexiones a red y todas estos detalles informáticos fueran a las mil maravillas. La estancia la financia la Universidad Politécnica de Cartagena en su programa de movilidad para PDI, representantes de estudiante y PAS de la UPCT (R-105_11) . La investigación que ha generado estos datos la financia la Fundación Séneca de la Región de Murcia -Centro Coordinación de la Investigación (proyecto "Análisis del efecto de QTLs que inducen cambios en la textura de la pulpa y la calidad global del fruto de melón"  11784/PI/09).



Panorámica de lo poco que queda ya de la huerta de Alboraya (Valencia)