miércoles, 27 de junio de 2018

El destrío de melón de diversos tipos destinado a alimentación de cabras en el campo de Cartagena.

Os dejo una fotografía de uno de los mayores consumidores de melón del campo de Cartagena en el momento de alimentarse. Además de melones de diversos tipos (cantalupo, amarillo, Piel de sapo), también aparecen restos de hortalizas. Las cabras son bastante poco delicadas. 27 de junio de 2018.

Alimentación de ganado (cabras) en verano de 2018 cerca de la ciudad de Cartagena. (C) Juan  Pablo Fernández Trujillo.

domingo, 17 de junio de 2018

La colección del COMAV de Valencia como fuente de variabilidad para mejora de melón futura en carotenoides y aromas.


Se ha publicado este trabajo:
Esteras, C., Rambla, J.L., Sánchez, G., López-Gresa, M.P. González-Mas, M.C., Fernández-Trujillo, J.P., Bellés, J.M., Granell, A., Picó, M.B. 2018. Fruit flesh volatile and carotenoid profile analysis within the Cucumis melo L. species reveals unexploited variability for future genetic breeding. J. Sci. Food Agric. 98:3915-3925. DOI: http://dx.doi.org/10.1002/jsfa.8909


En melón el contenido en nutrientes como carotenoides y de  compuestos aromáticos volátiles puede también alterarse mediante mejora genética vegetal clásica, ya que ambos atributos tienen una importante contribución genética e innegable valor para el consumidor y a nivel  comercial. Para ello se necesita conocer la variabilidad existente, que es  lo que hace este trabajo con 71 entradas seleccionadas del banco de germoplasma del (climatéricas y no climatéricas) de la colección principal del COMAV (Centro de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana). Se detectaron doscientos compuestos volátiles en la pulpa de la fruta, y posteriormente se emplearon como biomarcadores en un análisis de conglomerados que reveló la gran diversidad aromática natural aún no explotada en la mejora genética de melón. Además, se evaluó la presencia y los niveles de los principales carotenoides en un subconjunto de accesiones para resaltar aquellos con mayor valor nutricional y posible roles precursores de los apocarotenoides. Todo este conocimiento ayudará a diseñar estrategias para la mejora la calidad del melón.

Invernaderos de la UPV donde trabajan los investigadores del COMAV (c) J.P. Fernández Trujillo

Detalle de fruto de melón redondeado en el Invernaderos de la UPV donde trabajan los investigadores del COMAV (C) J.P. Fernández Trujillo


Invernaderos de la UPV donde trabajan los investigadores del COMAV (c) J.P. Fernández Trujillo


La potencialidad de la pulpa de melón en color debido a carotenoides es bastante interesante, y parte de esas diferencias de color están asociadas también a algunos aromas derivados de carotenoides. Sin embargo, parte de ellos proceden de ácidos grasos o de aminoácidos, así como de otros potenciales precursores. Este trabajo es el fruto de  la colaboración de diferentes grupos de investigación del COMAV, IBMCP-CSI-UPV y el equipo que lidera  el profesor Fernández-Trujilllo en la UPCT.


Semillero de planta de melón (entrada PI161375). (C) Juan Pablo  Fernández Trujillo




viernes, 1 de junio de 2018

Como detectar datos anómalos en medidas de aromas volátiles en melón no climatérico

Hoy se ha publicado en abierto el trabajo "Methodology to Remove Strong Outliers of Non-Climacteric Melon Fruit Aroma at Harvest Obtained by HS-SPME GC-MS Analysis" en el número especial de la revista Separations denominado "Issue Advances in Micro-Solid Phase Extraction", gracias a la colaboración que mantenemos con la profesora de estadística aplicada de la UPCT María del Carmen  Bueso.
 
Uno de los problemas de muchos trabajos científicos es el bajo nivel en el análisis exploratorio de datos y en la detección de datos anómalos, amén de la falta de una metodología estadística adecuada. Desde que cursé estadística (para aprobar, 1988) y posteriormente me pasé un cuatrimestre cursando estadística con Rafael Romero Villafranca en la UPV mediante el uso de herramientas informáticas (para aprender, 1989), me llamó siempre la atención la detección de outliers. He tenido la suerte en e l camino de tener colegas con interés en esto de la estadística como Pablo Botía, Antonio Monforte, Javier Obando, Bart Nicolai, Jeroe Lammertyn, Mari Carmen Bueso, y otros Treinta años después este trabajo y otro que tenemos casi aceptado abundan en los outliers. A veces se aprende mucho más de los errores que de los aciertos. El segundo trabajo menciona entre otros como analizar los efectos de los factores en la variabilidad, aplicando la metodología de mi profesor Rafael Romero Villafranca. Próximamente.

En este trabajo de melón lo que hemos pretendido es ayudar a la toma de decisiones para eliminar o no un dato anómalo. Los análisis  de compuestos  orgánicos volátiles en melones no climatéricos son bastante problemáticos porque aunque a nosotros unos 20 nos salieron muy consistentes, a veces el compuesto no da  señal.  Con melones climatéricos y aromáticos (los que producen olor) es más sencillo.

Melón tipo "Piel de sapo" híbrido listo para su venta por un productor de la región de  Murcia (España)



Este es un ejemplo de lo que se puede  hacer cuando se tienen muchísimas variables. Lo que nosotros pretendíamos es evitar el suprimir sin criterio datos que pueden ser de importancia para entender la variabilidad biológica del material, en este caso melones. Porque los melones al recolectarlos y según la campaña varían mucho en su gusto y aroma, aun estando maduros. En el caso de los no climatéricos la cosa es todavía más complicada, existiendo factores ambientales y de manejo del cultivo (suelo incluido) que complican extraordinariamente la cuestión.  Y en este caso es que son  frutos grandes (1.5-4 kg, según línea o cultivar), por lo que el trabajo a realizar  es mucho más tedioso que con otras especies.

Esta es la referencia  de la publicación que está en acceso abierto y con un abstract gráfico.


Fernández-Trujillo, J.P., Zarid, M., Bueso, M.C. 2018. Methodology to remove strong outliers of non-climacteric melon fruit aroma at harvest obtained by HS-SPME GC-MS analysis. Separations 5, 30. DOI:10.3390/separations5020030

Abstract: http://www.mdpi.com/2297-8739/5/2/30
HTML Version: http://www.mdpi.com/2297-8739/5/2/30/htm
PDF Version: http://www.mdpi.com/2297-8739/5/2/30/pdf

Este artículo pertenece al número especial (Special Issue): 
http://www.mdpi.com/journal/separations/special_issues/micro_solid_extraction


El trabajo forma parte de la tesis doctoral de Mohamed Zarid en la Universidad Politécnica de Cartagena (UPCT) dirigida por el profesor Fernández-Trujillo.


Si queréis  ver la diferencia y variabilidad aromática  en melón podéis  ir a este trabajo que comento en  otro post:
Esteras, C., Rambla, J.L., Sánchez, G., López-Gresa, M.P. González-Mas, M.C., Fernández-Trujillo, J.P., Bellés, J.M., Granell, A., Picó, M.B. 2018. Fruit flesh volatile and carotenoid profile analysis within the Cucumis melo L. species reveals unexploited variability for future genetic breeding. J. Sci. Food Agric. 98:3915-3925. DOI: http://dx.doi.org/10.1002/jsfa.8909. http://rdcu.be/JYp1